Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
J3KRW8 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
J3KRW8 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
J3KRW8 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
J3KRW8 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
J3KRW8 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
J3KRW8 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
J3KRW8 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
J3KRW8 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
J3KRW8 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
J3KRW8 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
J3KRW8 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
J3KRW8 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
J3KRW8 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
J3KRW8 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
J3KRW8 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
J3KRW8 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
J3KRW8 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
J3KRW8 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
J3KRW8 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
J3KRW8 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
J3KRW8 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
J3KRW8 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
J3KRW8 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
J3KRW8 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
J3KRW8 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
J3KRW8 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
J3KRW8 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
J3KRW8 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
J3KRW8 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
J3KRW8 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
J3KRW8 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
J3KRW8 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
J3KRW8 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
J3KRW8 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
J3KRW8 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
J3KRW8 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
J3KRW8 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
J3KRW8 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
J3KRW8 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
J3KRW8 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
J3KRW8 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
J3KRW8 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
J3KRW8 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
J3KRW8 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
J3KRW8 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
J3KRW8 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
J3KRW8 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
J3KRW8 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
J3KRW8 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
J3KRW8 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
J3KRW8 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
J3KRW8 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
J3KRW8 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
J3KRW8 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
J3KRW8 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
J3KRW8 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
J3KRW8 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
J3KRW8 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
J3KRW8 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
J3KRW8 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
J3KRW8 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
J3KRW8 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
J3KRW8 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
J3KRW8 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
J3KRW8 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
J3KRW8 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
J3KRW8 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
J3KRW8 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
J3KRW8 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
J3KRW8 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
J3KRW8 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
J3KRW8 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
J3KRW8 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
J3KRW8 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
J3KRW8 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
J3KRW8 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
J3KRW8 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
J3KRW8 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
J3KRW8 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
J3KRW8 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
J3KRW8 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-2.39□□□□□ -2.79
J3KRW8 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
J3KRW8 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
J3KRW8 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
J3KRW8 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
J3KRW8 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
J3KRW8 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
J3KRW8 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
J3KRW8 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
J3KRW8 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
J3KRW8 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
J3KRW8 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
J3KRW8 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
J3KRW8 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
J3KRW8 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
J3KRW8 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
J3KRW8 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
J3KRW8 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
J3KRW8 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.3 ms