Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
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PRRT1Q99946 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PRRT1Q99946 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
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