Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Hdac6Q9Z2V5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Hdac6Q9Z2V5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Hdac6Q9Z2V5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Hdac6Q9Z2V5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdac6Q9Z2V5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
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