Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms