Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Sh3bp5Q9Z131 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Sh3bp5Q9Z131 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Sh3bp5Q9Z131 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Sh3bp5Q9Z131 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Sh3bp5Q9Z131 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Sh3bp5Q9Z131 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Sh3bp5Q9Z131 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157 ms