Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms