Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms