Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Pus1Q9WU56 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Pus1Q9WU56 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pus1Q9WU56 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pus1Q9WU56 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pus1Q9WU56 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pus1Q9WU56 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pus1Q9WU56 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pus1Q9WU56 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pus1Q9WU56 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pus1Q9WU56 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pus1Q9WU56 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pus1Q9WU56 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pus1Q9WU56 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pus1Q9WU56 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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