Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms