Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms