Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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ChmlQ9QZD5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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ChmlQ9QZD5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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ChmlQ9QZD5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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ChmlQ9QZD5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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ChmlQ9QZD5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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ChmlQ9QZD5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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ChmlQ9QZD5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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ChmlQ9QZD5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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