Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms