Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK7

Rnf11, RING finger protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf11Q9QYK7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf11Q9QYK7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms