Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms