Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms