Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG4

Nkain4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain4Q9JMG4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nkain4Q9JMG4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nkain4Q9JMG4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nkain4Q9JMG4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nkain4Q9JMG4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nkain4Q9JMG4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nkain4Q9JMG4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nkain4Q9JMG4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nkain4Q9JMG4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Nkain4Q9JMG4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nkain4Q9JMG4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nkain4Q9JMG4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nkain4Q9JMG4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nkain4Q9JMG4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nkain4Q9JMG4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Nkain4Q9JMG4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nkain4Q9JMG4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nkain4Q9JMG4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nkain4Q9JMG4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nkain4Q9JMG4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nkain4Q9JMG4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nkain4Q9JMG4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nkain4Q9JMG4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nkain4Q9JMG4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nkain4Q9JMG4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nkain4Q9JMG4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms