Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc2lQ9JME7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc2lQ9JME7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc2lQ9JME7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc2lQ9JME7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc2lQ9JME7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc2lQ9JME7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc2lQ9JME7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc2lQ9JME7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc2lQ9JME7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc2lQ9JME7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc2lQ9JME7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc2lQ9JME7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc2lQ9JME7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc2lQ9JME7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc2lQ9JME7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc2lQ9JME7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc2lQ9JME7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc2lQ9JME7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc2lQ9JME7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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