Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms