Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc42ep4Q9JM96 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms