Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms