Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms