Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms