Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL21

Ccr10, C-C chemokine receptor type 10, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr10Q9JL21 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr10Q9JL21 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr10Q9JL21 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr10Q9JL21 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr10Q9JL21 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr10Q9JL21 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr10Q9JL21 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr10Q9JL21 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr10Q9JL21 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr10Q9JL21 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr10Q9JL21 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr10Q9JL21 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr10Q9JL21 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr10Q9JL21 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr10Q9JL21 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr10Q9JL21 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr10Q9JL21 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr10Q9JL21 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr10Q9JL21 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr10Q9JL21 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr10Q9JL21 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr10Q9JL21 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr10Q9JL21 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ccr10Q9JL21 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr10Q9JL21 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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