Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms