Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms