Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms