Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard6bQ9JK83 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms