Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms