Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Efcc1Q9JJF6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Efcc1Q9JJF6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Efcc1Q9JJF6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Efcc1Q9JJF6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Efcc1Q9JJF6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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