Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird1Q9JI57 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms