Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms