Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms