Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm7Q9ESD6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms