Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
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