Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snap29Q9ERB0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms