Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms