Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sil1Q9EPK6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms