Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms