Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms