Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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