Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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