Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb1Q9DAK3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms