Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Ift43Q9DA69 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Ift43Q9DA69 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms