Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms