Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms