Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slx4ipQ9D7Y9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms