Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Rep15Q9D7T1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Rep15Q9D7T1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Rep15Q9D7T1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Rep15Q9D7T1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Rep15Q9D7T1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Rep15Q9D7T1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Rep15Q9D7T1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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