Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Tmem54Q9D7S1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Tmem54Q9D7S1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Tmem54Q9D7S1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Tmem54Q9D7S1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem54Q9D7S1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Tmem54Q9D7S1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Tmem54Q9D7S1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Tmem54Q9D7S1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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