Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms