Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms